Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD1Q969G9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD1Q969G9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms