Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC112Q8NEF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC112Q8NEF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms