Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC1AQ8NC01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLEC1AQ8NC01 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC1AQ8NC01 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms