Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACUL1Q86Y37 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACUL1Q86Y37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms