Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC190Q86UF4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC190Q86UF4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms