Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMC6Q7Z403 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMC6Q7Z403 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC6Q7Z403 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms