Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D9Q6ZT07 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D9Q6ZT07 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TBC1D9Q6ZT07 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D9Q6ZT07 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms