Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA2Q69YH5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms