Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF20Q5VT98 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20Q5VT98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms