Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC183Q5T5S1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC183Q5T5S1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms