Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFYVE27Q5T4F4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ZFYVE27Q5T4F4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1367.7 ms