Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CT47A1Q5JQC4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CT47A1Q5JQC4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms