Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRRT3Q5FWE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT3Q5FWE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms