Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4orf17Q53FE4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf17Q53FE4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms