Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISXQ2M1V0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ISXQ2M1V0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms