Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETDB1Q15047 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETDB1Q15047 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETDB1Q15047 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETDB1Q15047 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETDB1Q15047 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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SETDB1Q15047 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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SETDB1Q15047 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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SETDB1Q15047 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETDB1Q15047 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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SETDB1Q15047 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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SETDB1Q15047 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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SETDB1Q15047 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
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SETDB1Q15047 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SETDB1Q15047 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
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