Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL1Q13616 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL1Q13616 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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