Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB3BPQ13352 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB3BPQ13352 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms