Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPN11Q06124 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN11Q06124 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN11Q06124 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN11Q06124 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms