Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3AQ05086 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3AQ05086 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms