Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCQQ04759 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCQQ04759 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms