Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP3Q02447 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP3Q02447 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP3Q02447 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP3Q02447 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP3Q02447 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP3Q02447 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP3Q02447 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP3Q02447 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP3Q02447 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP3Q02447 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP3Q02447 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP3Q02447 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP3Q02447 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP3Q02447 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP3Q02447 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP3Q02447 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP3Q02447 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP3Q02447 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SP3Q02447 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SP3Q02447 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SP3Q02447 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP3Q02447 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP3Q02447 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP3Q02447 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP3Q02447 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP3Q02447 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP3Q02447 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP3Q02447 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SP3Q02447 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP3Q02447 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP3Q02447 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP3Q02447 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SP3Q02447 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP3Q02447 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP3Q02447 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SP3Q02447 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP3Q02447 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP3Q02447 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP3Q02447 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP3Q02447 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP3Q02447 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP3Q02447 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SP3Q02447 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP3Q02447 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP3Q02447 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP3Q02447 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SP3Q02447 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SP3Q02447 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP3Q02447 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP3Q02447 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP3Q02447 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP3Q02447 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP3Q02447 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP3Q02447 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP3Q02447 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP3Q02447 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP3Q02447 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP3Q02447 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP3Q02447 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP3Q02447 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP3Q02447 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP3Q02447 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SP3Q02447 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP3Q02447 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SP3Q02447 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP3Q02447 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP3Q02447 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP3Q02447 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SP3Q02447 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP3Q02447 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP3Q02447 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP3Q02447 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP3Q02447 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP3Q02447 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP3Q02447 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP3Q02447 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP3Q02447 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP3Q02447 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP3Q02447 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP3Q02447 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP3Q02447 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP3Q02447 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP3Q02447 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP3Q02447 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms