Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP1S1P61966 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1S1P61966 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1S1P61966 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1S1P61966 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms