Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VBP1P61758 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VBP1P61758 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VBP1P61758 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VBP1P61758 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VBP1P61758 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VBP1P61758 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VBP1P61758 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VBP1P61758 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VBP1P61758 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VBP1P61758 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VBP1P61758 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VBP1P61758 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VBP1P61758 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VBP1P61758 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VBP1P61758 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VBP1P61758 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VBP1P61758 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VBP1P61758 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VBP1P61758 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VBP1P61758 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VBP1P61758 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VBP1P61758 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VBP1P61758 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VBP1P61758 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VBP1P61758 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VBP1P61758 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VBP1P61758 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VBP1P61758 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VBP1P61758 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VBP1P61758 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VBP1P61758 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VBP1P61758 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VBP1P61758 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VBP1P61758 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VBP1P61758 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VBP1P61758 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms