Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42P60953 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42P60953 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42P60953 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42P60953 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42P60953 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42P60953 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42P60953 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42P60953 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42P60953 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42P60953 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42P60953 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42P60953 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42P60953 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42P60953 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42P60953 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42P60953 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42P60953 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42P60953 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42P60953 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42P60953 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42P60953 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42P60953 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42P60953 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42P60953 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42P60953 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42P60953 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42P60953 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42P60953 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42P60953 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42P60953 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42P60953 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42P60953 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42P60953 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42P60953 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42P60953 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42P60953 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42P60953 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42P60953 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42P60953 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42P60953 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42P60953 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42P60953 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42P60953 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42P60953 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42P60953 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42P60953 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42P60953 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42P60953 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42P60953 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42P60953 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42P60953 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42P60953 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42P60953 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42P60953 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42P60953 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42P60953 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42P60953 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42P60953 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42P60953 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms