Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEFSECP57772 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EEFSECP57772 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms