Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AIF1P55008 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AIF1P55008 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AIF1P55008 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AIF1P55008 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AIF1P55008 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AIF1P55008 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AIF1P55008 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AIF1P55008 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AIF1P55008 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AIF1P55008 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AIF1P55008 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AIF1P55008 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AIF1P55008 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AIF1P55008 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AIF1P55008 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AIF1P55008 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AIF1P55008 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AIF1P55008 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AIF1P55008 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AIF1P55008 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AIF1P55008 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AIF1P55008 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AIF1P55008 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AIF1P55008 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AIF1P55008 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AIF1P55008 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AIF1P55008 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AIF1P55008 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AIF1P55008 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AIF1P55008 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AIF1P55008 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AIF1P55008 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AIF1P55008 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AIF1P55008 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AIF1P55008 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AIF1P55008 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AIF1P55008 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AIF1P55008 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AIF1P55008 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AIF1P55008 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AIF1P55008 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AIF1P55008 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AIF1P55008 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AIF1P55008 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AIF1P55008 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AIF1P55008 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AIF1P55008 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AIF1P55008 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AIF1P55008 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AIF1P55008 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AIF1P55008 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AIF1P55008 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AIF1P55008 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AIF1P55008 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AIF1P55008 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AIF1P55008 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AIF1P55008 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AIF1P55008 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AIF1P55008 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AIF1P55008 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AIF1P55008 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AIF1P55008 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AIF1P55008 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AIF1P55008 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AIF1P55008 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AIF1P55008 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AIF1P55008 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AIF1P55008 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AIF1P55008 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AIF1P55008 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AIF1P55008 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AIF1P55008 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AIF1P55008 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AIF1P55008 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AIF1P55008 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AIF1P55008 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms