Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN5P54829 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN5P54829 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms