Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN1P53805 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN1P53805 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN1P53805 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RCAN1P53805 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN1P53805 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms