Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERFP50548 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERFP50548 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERFP50548 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERFP50548 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERFP50548 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERFP50548 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERFP50548 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERFP50548 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERFP50548 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERFP50548 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERFP50548 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERFP50548 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERFP50548 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERFP50548 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERFP50548 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERFP50548 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERFP50548 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERFP50548 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERFP50548 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERFP50548 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERFP50548 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERFP50548 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERFP50548 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERFP50548 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERFP50548 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERFP50548 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERFP50548 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERFP50548 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERFP50548 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERFP50548 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERFP50548 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERFP50548 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERFP50548 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERFP50548 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERFP50548 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERFP50548 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERFP50548 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERFP50548 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERFP50548 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERFP50548 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERFP50548 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERFP50548 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERFP50548 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERFP50548 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERFP50548 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERFP50548 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERFP50548 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERFP50548 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERFP50548 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERFP50548 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERFP50548 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERFP50548 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERFP50548 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERFP50548 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ERFP50548 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ERFP50548 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERFP50548 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERFP50548 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERFP50548 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERFP50548 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERFP50548 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms