Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A3P48751 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A3P48751 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms