Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR3P41439 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOLR3P41439 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR3P41439 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms