Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSKP41240 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSKP41240 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSKP41240 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSKP41240 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSKP41240 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSKP41240 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSKP41240 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSKP41240 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSKP41240 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSKP41240 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSKP41240 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSKP41240 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSKP41240 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSKP41240 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSKP41240 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSKP41240 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSKP41240 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSKP41240 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSKP41240 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSKP41240 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSKP41240 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSKP41240 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSKP41240 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSKP41240 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSKP41240 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSKP41240 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSKP41240 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSKP41240 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSKP41240 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSKP41240 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSKP41240 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSKP41240 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSKP41240 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSKP41240 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSKP41240 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSKP41240 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSKP41240 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSKP41240 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSKP41240 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSKP41240 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSKP41240 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSKP41240 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSKP41240 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSKP41240 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSKP41240 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSKP41240 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSKP41240 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSKP41240 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSKP41240 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSKP41240 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSKP41240 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSKP41240 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSKP41240 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSKP41240 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSKP41240 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSKP41240 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSKP41240 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSKP41240 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSKP41240 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSKP41240 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSKP41240 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSKP41240 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSKP41240 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSKP41240 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSKP41240 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSKP41240 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSKP41240 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms