Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 ECM10YEL030W 1935 nt7.01□□□□□ -1.29
VFA1P40080 PHO3YBR092C 1404 nt7.01□□□□□ -1.29
VFA1P40080 FMO1YHR176W 1299 nt6.99□□□□□ -1.29
VFA1P40080 AIM24YJR080C 1185 nt6.99□□□□□ -1.29
VFA1P40080 YGR054WYGR054W 1929 nt6.99□□□□□ -1.29
VFA1P40080 CLN1YMR199W 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
VFA1P40080 VMA3YEL027W 483 nt6.98□□□□□ -1.29
VFA1P40080 LYS1YIR034C 1122 nt6.98□□□□□ -1.29
VFA1P40080 UBP13YBL067C 2244 nt6.98□□□□□ -1.29
VFA1P40080 CCR4YAL021C 2514 nt6.98□□□□□ -1.29
VFA1P40080 SNU71YGR013W 1863 nt6.98□□□□□ -1.29
VFA1P40080 NPL6YMR091C 1308 nt6.98□□□□□ -1.29
VFA1P40080 CCT8YJL008C 1707 nt6.97□□□□□ -1.29
VFA1P40080 MDE1YJR024C 735 nt6.97□□□□□ -1.29
VFA1P40080 TAF9YMR236W 474 nt6.97□□□□□ -1.29
VFA1P40080 RUF23RUF23 254 nt6.97□□□□□ -1.29
VFA1P40080 RKI1YOR095C 777 nt6.97□□□□□ -1.29
VFA1P40080 ARE2YNR019W 1929 nt6.96□□□□□ -1.3
VFA1P40080 PRY3YJL078C 2646 nt6.96□□□□□ -1.3
VFA1P40080 YOR300WYOR300W 309 nt6.96□□□□□ -1.3
VFA1P40080 LDB16YCL005W 771 nt6.96□□□□□ -1.3
VFA1P40080 SAL1YNL083W 1485 nt6.96□□□□□ -1.3
VFA1P40080 CRP1YHR146W 1398 nt6.95□□□□□ -1.3
VFA1P40080 FPR2YDR519W 408 nt6.95□□□□□ -1.3
VFA1P40080 CTF19YPL018W 1110 nt6.95□□□□□ -1.3
VFA1P40080 PEX3YDR329C 1326 nt6.95□□□□□ -1.3
VFA1P40080 GPD2YOL059W 1323 nt6.95□□□□□ -1.3
VFA1P40080 GLN3YER040W 2193 nt6.95□□□□□ -1.3
VFA1P40080 NSG2YNL156C 900 nt6.94□□□□□ -1.3
VFA1P40080 COQ3YOL096C 939 nt6.94□□□□□ -1.3
VFA1P40080 YJL045WYJL045W 1905 nt6.93□□□□□ -1.3
VFA1P40080 ADE2YOR128C 1716 nt6.93□□□□□ -1.3
VFA1P40080 YKR045CYKR045C 552 nt6.93□□□□□ -1.3
VFA1P40080 MRPS18YNL306W 654 nt6.93□□□□□ -1.3
VFA1P40080 MSO1YNR049C 633 nt6.93□□□□□ -1.3
VFA1P40080 ILV6YCL009C 930 nt6.93□□□□□ -1.3
VFA1P40080 SNU66YOR308C 1764 nt6.92□□□□□ -1.3
VFA1P40080 CIT3YPR001W 1461 nt6.92□□□□□ -1.3
VFA1P40080 GCG1YER163C 699 nt6.91□□□□□ -1.3
VFA1P40080 SRL2YLR082C 1179 nt6.91□□□□□ -1.3
VFA1P40080 PTC4YBR125C 1182 nt6.91□□□□□ -1.3
VFA1P40080 HRQ1YDR291W 3234 nt6.91□□□□□ -1.3
VFA1P40080 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.9□□□□□ -1.3
VFA1P40080 VPS61YDR136C 573 nt6.9□□□□□ -1.3
VFA1P40080 EMP65YER140W 1671 nt6.9□□□□□ -1.31
VFA1P40080 PGM1YKL127W 1713 nt6.9□□□□□ -1.31
VFA1P40080 OM45YIL136W 1182 nt6.89□□□□□ -1.31
VFA1P40080 ICS3YJL077C 396 nt6.89□□□□□ -1.31
VFA1P40080 QCR8YJL166W 285 nt6.89□□□□□ -1.31
VFA1P40080 MHT1YLL062C 975 nt6.89□□□□□ -1.31
VFA1P40080 PEX13YLR191W 1161 nt6.89□□□□□ -1.31
VFA1P40080 ECM31YBR176W 939 nt6.89□□□□□ -1.31
VFA1P40080 AGP2YBR132C 1791 nt6.89□□□□□ -1.31
VFA1P40080 YHC3YJL059W 1227 nt6.88□□□□□ -1.31
VFA1P40080 MEH1YKR007W 555 nt6.88□□□□□ -1.31
VFA1P40080 TSR2YLR435W 618 nt6.88□□□□□ -1.31
VFA1P40080 GTO3YMR251W 1101 nt6.88□□□□□ -1.31
VFA1P40080 IES2YNL215W 963 nt6.88□□□□□ -1.31
VFA1P40080 PPT1YGR123C 1542 nt6.87□□□□□ -1.31
VFA1P40080 PTC3YBL056W 1407 nt6.87□□□□□ -1.31
VFA1P40080 YHR145CYHR145C 357 nt6.87□□□□□ -1.31
VFA1P40080 BSC4YNL269W 396 nt6.87□□□□□ -1.31
VFA1P40080 RTG2YGL252C 1767 nt6.87□□□□□ -1.31
VFA1P40080 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.86□□□□□ -1.31
VFA1P40080 YIR042CYIR042C 711 nt6.86□□□□□ -1.31
VFA1P40080 LCB3YJL134W 1230 nt6.86□□□□□ -1.31
VFA1P40080 KTR1YOR099W 1182 nt6.86□□□□□ -1.31
VFA1P40080 MOD5YOR274W 1287 nt6.86□□□□□ -1.31
VFA1P40080 ERG8YMR220W 1356 nt6.85□□□□□ -1.31
VFA1P40080 GTT3YEL017W 1014 nt6.85□□□□□ -1.31
VFA1P40080 ORM1YGR038W 669 nt6.85□□□□□ -1.31
VFA1P40080 DMA1YHR115C 1251 nt6.85□□□□□ -1.31
VFA1P40080 COA1YIL157C 594 nt6.85□□□□□ -1.31
VFA1P40080 YUR1YJL139C 1287 nt6.85□□□□□ -1.31
VFA1P40080 AMD2YDR242W 1650 nt6.84□□□□□ -1.31
VFA1P40080 TMT1YER175C 900 nt6.84□□□□□ -1.31
VFA1P40080 ECM30YLR436C 3825 nt6.84□□□□□ -1.31
VFA1P40080 GEF1YJR040W 2340 nt6.83□□□□□ -1.32
VFA1P40080 VTS1YOR359W 1572 nt6.82□□□□□ -1.32
VFA1P40080 MAM3YOL060C 2121 nt6.82□□□□□ -1.32
VFA1P40080 ACO1YLR304C 2337 nt6.82□□□□□ -1.32
VFA1P40080 POP5YAL033W 522 nt6.82□□□□□ -1.32
VFA1P40080 KNS1YLL019C 2214 nt6.82□□□□□ -1.32
VFA1P40080 YBR027CYBR027C 333 nt6.81□□□□□ -1.32
VFA1P40080 RPL21AYBR191W 483 nt6.81□□□□□ -1.32
VFA1P40080 ISC1YER019W 1434 nt6.81□□□□□ -1.32
VFA1P40080 GCD11YER025W 1584 nt6.81□□□□□ -1.32
VFA1P40080 IMG1YCR046C 510 nt6.8□□□□□ -1.32
VFA1P40080 GPI11YDR302W 660 nt6.8□□□□□ -1.32
VFA1P40080 DUS4YLR405W 1104 nt6.8□□□□□ -1.32
VFA1P40080 SGF29YCL010C 780 nt6.8□□□□□ -1.32
VFA1P40080 YMR279CYMR279C 1623 nt6.79□□□□□ -1.32
VFA1P40080 UIP5YKR044W 1332 nt6.79□□□□□ -1.32
VFA1P40080 ERG12YMR208W 1332 nt6.79□□□□□ -1.32
VFA1P40080 BUG1YDL099W 1026 nt6.79□□□□□ -1.32
VFA1P40080 FPR3YML074C 1236 nt6.79□□□□□ -1.32
VFA1P40080 ZWF1YNL241C 1518 nt6.79□□□□□ -1.32
VFA1P40080 YTP1YNL237W 1380 nt6.79□□□□□ -1.32
VFA1P40080 SHO1YER118C 1104 nt6.78□□□□□ -1.32
VFA1P40080 GLC8YMR311C 690 nt6.78□□□□□ -1.32
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