Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
IGHMBP2P38935 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHMBP2P38935 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHMBP2P38935 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms