Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASQ1P31415 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASQ1P31415 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASQ1P31415 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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