Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP1P29466 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP1P29466 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP1P29466 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP1P29466 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP1P29466 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP1P29466 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP1P29466 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP1P29466 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP1P29466 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP1P29466 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP1P29466 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP1P29466 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP1P29466 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP1P29466 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP1P29466 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP1P29466 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP1P29466 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP1P29466 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP1P29466 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP1P29466 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP1P29466 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP1P29466 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP1P29466 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP1P29466 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP1P29466 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP1P29466 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP1P29466 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP1P29466 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP1P29466 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP1P29466 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP1P29466 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP1P29466 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP1P29466 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP1P29466 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP1P29466 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP1P29466 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP1P29466 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP1P29466 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP1P29466 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP1P29466 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP1P29466 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP1P29466 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP1P29466 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP1P29466 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP1P29466 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP1P29466 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP1P29466 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP1P29466 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP1P29466 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP1P29466 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP1P29466 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP1P29466 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP1P29466 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms