Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD1CP29017 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD1CP29017 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD1CP29017 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1CP29017 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1CP29017 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1CP29017 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1CP29017 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1CP29017 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1CP29017 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1CP29017 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1CP29017 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1CP29017 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1CP29017 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1CP29017 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1CP29017 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1CP29017 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD1CP29017 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD1CP29017 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD1CP29017 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD1CP29017 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD1CP29017 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1CP29017 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD1CP29017 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD1CP29017 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD1CP29017 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD1CP29017 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1CP29017 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1CP29017 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1CP29017 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1CP29017 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1CP29017 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1CP29017 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1CP29017 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1CP29017 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1CP29017 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1CP29017 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1CP29017 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1CP29017 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1CP29017 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1CP29017 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1CP29017 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1CP29017 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD1CP29017 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD1CP29017 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD1CP29017 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD1CP29017 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD1CP29017 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD1CP29017 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1CP29017 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD1CP29017 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD1CP29017 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms