Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARK3P27448 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARK3P27448 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MARK3P27448 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARK3P27448 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARK3P27448 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARK3P27448 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARK3P27448 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARK3P27448 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARK3P27448 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARK3P27448 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARK3P27448 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARK3P27448 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARK3P27448 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARK3P27448 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARK3P27448 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARK3P27448 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARK3P27448 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARK3P27448 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARK3P27448 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MARK3P27448 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARK3P27448 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARK3P27448 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARK3P27448 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARK3P27448 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARK3P27448 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARK3P27448 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARK3P27448 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARK3P27448 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARK3P27448 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARK3P27448 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MARK3P27448 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARK3P27448 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARK3P27448 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARK3P27448 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARK3P27448 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARK3P27448 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MARK3P27448 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARK3P27448 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARK3P27448 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARK3P27448 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARK3P27448 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARK3P27448 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARK3P27448 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARK3P27448 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARK3P27448 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARK3P27448 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARK3P27448 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARK3P27448 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARK3P27448 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARK3P27448 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARK3P27448 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MARK3P27448 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MARK3P27448 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARK3P27448 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARK3P27448 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARK3P27448 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARK3P27448 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARK3P27448 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARK3P27448 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARK3P27448 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARK3P27448 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARK3P27448 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARK3P27448 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARK3P27448 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARK3P27448 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARK3P27448 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MARK3P27448 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARK3P27448 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARK3P27448 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARK3P27448 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARK3P27448 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARK3P27448 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARK3P27448 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARK3P27448 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARK3P27448 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARK3P27448 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MARK3P27448 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARK3P27448 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARK3P27448 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARK3P27448 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARK3P27448 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MARK3P27448 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MARK3P27448 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARK3P27448 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARK3P27448 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARK3P27448 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARK3P27448 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARK3P27448 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARK3P27448 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms