Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF4P23510 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFSF4P23510 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms