Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4BPBP20851 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C4BPBP20851 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms