Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF4P18848 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF4P18848 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF4P18848 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF4P18848 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF4P18848 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF4P18848 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF4P18848 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF4P18848 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF4P18848 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF4P18848 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF4P18848 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF4P18848 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF4P18848 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF4P18848 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF4P18848 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF4P18848 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF4P18848 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF4P18848 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATF4P18848 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATF4P18848 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF4P18848 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF4P18848 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF4P18848 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF4P18848 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATF4P18848 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF4P18848 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATF4P18848 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF4P18848 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF4P18848 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF4P18848 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF4P18848 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF4P18848 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF4P18848 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF4P18848 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATF4P18848 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATF4P18848 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATF4P18848 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATF4P18848 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATF4P18848 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATF4P18848 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATF4P18848 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATF4P18848 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATF4P18848 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATF4P18848 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATF4P18848 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATF4P18848 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms