Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP1P17987 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP1P17987 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP1P17987 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP1P17987 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP1P17987 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP1P17987 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP1P17987 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP1P17987 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP1P17987 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP1P17987 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP1P17987 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP1P17987 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP1P17987 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP1P17987 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP1P17987 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP1P17987 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP1P17987 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP1P17987 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP1P17987 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP1P17987 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP1P17987 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP1P17987 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP1P17987 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP1P17987 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP1P17987 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP1P17987 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP1P17987 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP1P17987 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP1P17987 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP1P17987 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP1P17987 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP1P17987 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP1P17987 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP1P17987 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP1P17987 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP1P17987 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP1P17987 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP1P17987 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP1P17987 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP1P17987 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP1P17987 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP1P17987 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP1P17987 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP1P17987 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP1P17987 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP1P17987 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP1P17987 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP1P17987 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP1P17987 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP1P17987 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP1P17987 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP1P17987 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP1P17987 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP1P17987 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP1P17987 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP1P17987 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP1P17987 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP1P17987 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP1P17987 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms