Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB8P17481 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB8P17481 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB8P17481 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms