Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF28P17035 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF28P17035 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF28P17035 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms