Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL4P12829 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL4P12829 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL4P12829 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL4P12829 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL4P12829 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL4P12829 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL4P12829 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL4P12829 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL4P12829 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL4P12829 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL4P12829 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL4P12829 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL4P12829 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL4P12829 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL4P12829 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL4P12829 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL4P12829 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL4P12829 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL4P12829 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL4P12829 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL4P12829 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL4P12829 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL4P12829 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL4P12829 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL4P12829 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL4P12829 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL4P12829 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL4P12829 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL4P12829 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL4P12829 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL4P12829 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL4P12829 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL4P12829 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL4P12829 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL4P12829 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL4P12829 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL4P12829 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL4P12829 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL4P12829 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL4P12829 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL4P12829 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL4P12829 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL4P12829 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL4P12829 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL4P12829 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL4P12829 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL4P12829 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL4P12829 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL4P12829 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL4P12829 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL4P12829 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYL4P12829 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYL4P12829 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYL4P12829 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYL4P12829 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MYL4P12829 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYL4P12829 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYL4P12829 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYL4P12829 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYL4P12829 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYL4P12829 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYL4P12829 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYL4P12829 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYL4P12829 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYL4P12829 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYL4P12829 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MYL4P12829 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MYL4P12829 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYL4P12829 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYL4P12829 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYL4P12829 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYL4P12829 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYL4P12829 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYL4P12829 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYL4P12829 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms