Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIP12755 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIP12755 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIP12755 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIP12755 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIP12755 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIP12755 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIP12755 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SKIP12755 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIP12755 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIP12755 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIP12755 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIP12755 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIP12755 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIP12755 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIP12755 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIP12755 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIP12755 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIP12755 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIP12755 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIP12755 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIP12755 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIP12755 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIP12755 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIP12755 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIP12755 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIP12755 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIP12755 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIP12755 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIP12755 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIP12755 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIP12755 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIP12755 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIP12755 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIP12755 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIP12755 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIP12755 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIP12755 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIP12755 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIP12755 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIP12755 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIP12755 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIP12755 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIP12755 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIP12755 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIP12755 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIP12755 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIP12755 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIP12755 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIP12755 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIP12755 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIP12755 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIP12755 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKIP12755 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKIP12755 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIP12755 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIP12755 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIP12755 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIP12755 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIP12755 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIP12755 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIP12755 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIP12755 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIP12755 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIP12755 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIP12755 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIP12755 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIP12755 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIP12755 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIP12755 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIP12755 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIP12755 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIP12755 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIP12755 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIP12755 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIP12755 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIP12755 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIP12755 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIP12755 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms