Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM1P11229 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRM1P11229 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms