Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI4P10075 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI4P10075 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI4P10075 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI4P10075 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI4P10075 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI4P10075 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI4P10075 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI4P10075 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI4P10075 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI4P10075 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI4P10075 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI4P10075 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI4P10075 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLI4P10075 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLI4P10075 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLI4P10075 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI4P10075 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI4P10075 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI4P10075 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI4P10075 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI4P10075 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI4P10075 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI4P10075 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI4P10075 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI4P10075 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI4P10075 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI4P10075 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI4P10075 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI4P10075 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI4P10075 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI4P10075 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI4P10075 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI4P10075 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI4P10075 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLI4P10075 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GLI4P10075 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GLI4P10075 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GLI4P10075 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GLI4P10075 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GLI4P10075 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GLI4P10075 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GLI4P10075 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GLI4P10075 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GLI4P10075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GLI4P10075 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GLI4P10075 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GLI4P10075 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GLI4P10075 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI4P10075 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI4P10075 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI4P10075 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI4P10075 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI4P10075 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI4P10075 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI4P10075 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI4P10075 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI4P10075 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI4P10075 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI4P10075 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI4P10075 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI4P10075 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI4P10075 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI4P10075 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI4P10075 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI4P10075 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI4P10075 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI4P10075 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI4P10075 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI4P10075 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GLI4P10075 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI4P10075 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI4P10075 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms