Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2CP0DJJ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2CP0DJJ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms